怪盗基德的预告信出现在了北海道函馆，斧江财阀的收藏库中。这次基德将要盗走的是江戸幕府时期新选组副长土方岁三的日本刀。线上看基德为何会放弃奢华宝石，转而追逐这把古刀？此时，西部名侦探服部平次和柯南一行人也因剑道大会来到函馆，在基德执行预告的当日，平次看穿了基德的伪装并对其穷追不舍！与此同时，一具胸口有十字伤口的尸体在函馆仓库街被发现。        搜查过程中，一位活跃于亚洲的美籍日裔军火商“死之商人”现身，他一直在寻找斧江家初代家主藏在函馆的宝藏。传说这宝藏是能扭转幕末纷争的强力武器，而这宝藏似乎与基德欲盗取的日本刀有着千丝万缕的联系。线上看基德如何在瞄准古刀的同时，与一位神秘剑士展开一场激烈对决，解开幕府时代的惊天秘密。